In 1992 verklaarde Bosnië en Herzegovina zich onafhankelijk van Joegoslavië. Hierop volgde de Bosnische Burgeroorlog tussen de Bosniakken, Bosnische Kroaten en de Bosnische Serviërs. Deze oorlog wordt gezien als de gruwelijkste oorlog na de Tweede Wereldoorlog in Europa. Er werden etnische zuiveringen en massamoorden gepleegd en veel steden werden zwaar beschadigd, waarbij veel burgers om het leven kwamen. In Mostar vochten eerst Bosniakken en Kroaten samen tegen het Joegoslavische leger, daarna stonden Bosnische Kroaten en Bosniakken tegenover elkaar. In Mostar is de Stari Most het belangrijkste symbool van deze oorlog. In Mostar zijn nog steeds behoorlijk wat littekens van deze gruwelijke oorlog terug te vinden. Zo kom je er behoorlijk wat gedenktekens tegen en staan er, vooral langs de vroegere frontlinie, nog steeds kapotgeschoten gebouwen.
