De haven van Funchal ligt vaak helemaal vol met grote cruiseboten. Een aantal keer in de week worden hier drommen toeristen uitgeladen die een dag van het eiland kunnen genieten. Veel cruiseschepen combineren Madeira met de Canarische Eilanden en soms de Azoren. In de haven is ook een gedeelte voor zeiljachten die klaarliggen om de grote oversteek te maken over de oceaan. Daarnaast vind je er de boten voor de toeristen om dolfijnen en walvissen te spotten. Wie naar Porto Santo wil kan vanaf hier de veerboot pakken naar het nabijgelegen eiland.
De haven ligt op loopafstand van het centrum en de boulevard, zodat cruisepassagiers de stad gemakkelijk te voet kunnen verkennen.
