In het midden van de stad aan de Rue Jean-Jacques Rousseau ligt de kathedraal van Annecy. Het is een indrukwekkend gebouw uit de vroege renaissance, waarvan de gevel uit 1535 dateert. De kerk hoorde oorspronkelijk bij een klooster dat in 1534 werd overgenomen door de franciscanen. Buiten het imposante orgel uit 1840-1842 is de kerk vrij sober. Dat is ongewoon voor een kathedraal, maar niet verwonderlijk als je weet dat de kerk ten tijde van de Franse Revolutie werd gebruikt als tempel van de Rede. In een poging alle invloed van de kerk op de staat uit te roeien werden kerken gesloten en ontdaan van hun heilige versierselen. Veel kerken gingen dienst doen als tempels van de rede. Een cultus van de rede die gebaseerd was op de ideeën van verlichte denkers zoals Voltaire en Rousseau. De laatst genoemde woonde zelfs vlakbij de kerk. Hij kreeg er onderdak nadat hij uit Genève was gevlucht. In de kerk staat een beeld van hem terwijl hij muziekles krijgt. Ook de favoriete heilige van de stad, François de Sales, heeft hier zijn eigen altaar. Hij was in de 17e eeuw bisschop in deze kerk.
